غربالگری لاین های آلوپلاسمیک برنج (oryza sativa l.) با استفاده از نشانگر مولکولی rapd

نویسندگان

سیدحمیدرضا هاشمی

قربانعلی نعمت زاده

سید محمد علوی

مرتضی اولادی

چکیده

در سیستم سه لاینی تولید بذر هیبرید برنج، بخش اعظمی از ناخالصی ژنتیکی در مرحله تکثیر و نگهداری لاین های نر عقیم سیتوپلاسمی (cms) صورت می گیرد، در نتیجه بذور لاین های cms با بذور لاین های نگهدارنده (b) اختلاط می یابند. در این راستا انگشت نگاری لاین های اصلاحی و شناسایی نشانگرهای اختصاصی، پیش زمینه آزمون خلوص ژنتیکی این لاین ها است. بدین منظور شش لاین نر عقیم سیتوپلاسمی شامل ندا a، نعمت a، دشت a، چمپا a، آمل3 a و ir58025a به همراه شش لاین نگهدارنده باروری با استفاده از 25 آغازگر rapd مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفتند. به دلیل زمینه ژنتیکـی مشابه لاین های cms و نگهدارنده، لاین های ایزوژن در اکثر مکان های نشانگری از الگوی باندی یکسانی برخوردار بودند. در این پژوهش تنها در مورد آغازگرهای oph20 و oph01 به ترتیب قطعه 950 و 850 نوکلئوتیدی شناسایی گردیدند که قادر به تمایز لاین های cms و لاین های b از یکدیگر می باشند یعنی لاین های c‏ms دارای باندهای اختصاصی بوده، در حالی که لاین های نگهدارنده فاقد قطعه مذبور می باشند. جهت بررسی ماهیت هسته ای یا سیتوپلاسمی بودن این باندها، قطعه oph20-950 bp از لاین های ندا a و ir58025a جداسازی و با استفاده از سیستم t/a در باکتری escherichia coli سویه dh5 همسانه سازی و نهایتاً تعیین ترادف گردیدند. آنالیزهای همردیفی قطعه مورد نظر با توالی موجود در بانک ژن، نشان دهنده همولوژی 95 درصدی با توالی ژنوم میتوکندریایی بود. تحقیقا از نتایج این مطالعه می توان در شناسایی و بررسی خلوص ژنتیکی لاین های cms (نوع wa) استفاده نمود.

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

غربالگری لاین‌های آلوپلاسمیک برنج (Oryza sativa L.) با استفاده از نشانگر مولکولی RAPD

In three-line system, cytoplasmic male sterile (CMS) lines often were contaminated with cognate iso-nuclear maintainer lines during seeds multiplication processes. Therefore fingerprinting of breeding lines and identification of line-specific markers are prerequisite in genetic purity test. Six CMS lines including Neda-A, Nemat-A, Dasht-A, Amol 3-A, Champa-A, IR58025A and their iso-nuclear main...

متن کامل

بررسی تنوع ژنتیکی ارقام و لاین های برنج (Oryza sativa L.) با استفاده از صفات کمی

  به منظور تعیین تنوع ژنتیکی بخشی از ژرم پلاسم برنج کشور، تعداد 56 ژنوتیپ شامل ارقام و لاین های برنج، در مزرعه آزمایشی معاونت مؤسسه تحقیقات برنج کشور (آمل) کشت گردید. در این آزمایش 15 صفت زراعی اندازه گیری شد. محاسبات آماری شامل: تجزیه واریانس برای هر صفت، گروه بندی ارقام با استفاده از تجزیه خوشه ای، محاسبه میانگین، انحراف معیار، دامنه تغییرات و ضریب تغییرات انجام گرفت. برای کلیه صفات، ضرایب هم...

متن کامل

Genetic polymorphism in rice (Oryza sativa L.) through RAPD analysis

Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) assay was performed to estimate genetic polymorphism in six different rice (Oryza sativa L.) cultivars viz. Basmati 370, DM 25, IRATOM 24, Binadhan 6, TNDB 100 and Y 1281. Three out of the 15 decamer random primers showed amplification of genomic DNA in 24 individuals. The primers produced a total of 26 bands of which 14 were polymorphic. Proportion of po...

متن کامل

ارزیابی لاین های موتانت پیشرفته برنج (Oryza sativa L.) طارم محلی با استفاده از تجزیه علیت و عامل ها

سابقه و هدف: با توجه به اهمیت غذائی برنج و همچنین افزایش جمعیت، ایجاد لاین‌های جدید برنج و به دنبال آن گزینش برای بهبود عملکردآنها ضروری است. شناسائی اثرات مستقیم و غیر مستقیم صفات مؤثر بر عملکرد دانه موجب تسهیل در یک گزینش موفق می‌شود. با توجه به اهمیت عوامل پنهانی در شکل‌گیری صفات و تأثیر آنها بر عملکرد دانه، لزوم تعیین مسیر‌های برهمکنش اجزای عملکرد بر عملکرد دانه جهت بهبود در برنامه‌های اصلا...

متن کامل

بررسی تنوع ژنتیکی ارقام و لاین های برنج (oryza sativa l.) با استفاده از صفات کمی

به منظور تعیین تنوع ژنتیکی بخشی از ژرم پلاسم برنج کشور، تعداد 56 ژنوتیپ شامل ارقام و لاین های برنج، در مزرعه آزمایشی معاونت مؤسسه تحقیقات برنج کشور (آمل) کشت گردید. در این آزمایش 15 صفت زراعی اندازه گیری شد. محاسبات آماری شامل: تجزیه واریانس برای هر صفت، گروه بندی ارقام با استفاده از تجزیه خوشه ای، محاسبه میانگین، انحراف معیار، دامنه تغییرات و ضریب تغییرات انجام گرفت. برای کلیه صفات، ضرایب همبس...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید


عنوان ژورنال:
پژوهشنامه اصلاح گیاهان زراعی

جلد ۱، شماره ۲، صفحات ۴۳-۵۴

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023